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| PTK7 | Q13308 | AC092783.1-201 | ENST00000435832 | 231 nt | TSL 3 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-41P-201 | ENST00000516161 | 162 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-48P-201 | ENST00000516400 | 162 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-181P-201 | ENST00000517234 | 74 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MIR450A1-201 | ENST00000362262 | 91 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTK7 | Q13308 | SNORA67.1-201 | ENST00000364749 | 141 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC021613.1-201 | ENST00000623880 | 111 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | CENPE-201 | ENST00000265148 | 8612 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | MACC1-202 | ENST00000400331 | 9159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC003984.1-201 | ENST00000450977 | 4104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC011753.1-201 | ENST00000451001 | 220 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC012668.1-201 | ENST00000457625 | 228 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-67P-201 | ENST00000459003 | 62 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP320-201 | ENST00000516263 | 124 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA31.15-201 | ENST00000516771 | 132 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | HMSD-204 | ENST00000526932 | 162 nt | TSL 3 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC024614.2-201 | ENST00000577584 | 372 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | HSPE1P19-201 | ENST00000603327 | 295 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | AP000648.3-201 | ENST00000623539 | 4507 nt | BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF470-202 | ENST00000391709 | 6601 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | OR2J3-203 | ENST00000641960 | 3342 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZBTB6-201 | ENST00000373659 | 4106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR424-201 | ENST00000362227 | 98 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.163-201 | ENST00000363702 | 113 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA3A-201 | ENST00000364113 | 130 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1014P-201 | ENST00000383940 | 103 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1113P-201 | ENST00000384348 | 107 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.494-201 | ENST00000384432 | 111 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-360P-201 | ENST00000390944 | 104 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |