Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RPA4Q13156 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms