Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
IFT88Q13099 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFT88Q13099 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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