Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GPS1Q13098 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
GPS1Q13098 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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