Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GAGE4Q13068 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GAGE4Q13068 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.8 ms