Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ECH1Q13011 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ECH1Q13011 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ECH1Q13011 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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