Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CASQ1P31415 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CASQ1P31415 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms