Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
VPREB1P12018 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
VPREB1P12018 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms