Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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CLDN9O95484 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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CLDN9O95484 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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CLDN9O95484 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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CLDN9O95484 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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CLDN9O95484 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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