Protein–RNA interactions for Protein: O75954

TSPAN9, Tetraspanin-9, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9O75954 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN9O75954 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TSPAN9O75954 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.8 ms