Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
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