Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GDE1Q9NZC3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
GDE1Q9NZC3 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GDE1Q9NZC3 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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