Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD1Q9GZZ0 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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