Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PRAC1Q96KF2 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms