Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms