Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
BEST4Q8NFU0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BEST4Q8NFU0 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms