Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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USP53Q70EK8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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USP53Q70EK8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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