Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CTXN3Q4LDR2 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CTXN3Q4LDR2 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CTXN3Q4LDR2 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CTXN3Q4LDR2 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CTXN3Q4LDR2 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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