Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Q1T7F1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 417.2 ms