Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
LAMA3Q16787 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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LAMA3Q16787 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
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LAMA3Q16787 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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LAMA3Q16787 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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LAMA3Q16787 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
LAMA3Q16787 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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