Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CLPPQ16740 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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