Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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VAMP3Q15836 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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VAMP3Q15836 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
VAMP3Q15836 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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