Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SIX1Q15475 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SIX1Q15475 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SIX1Q15475 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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