Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SEC23AQ15436 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23AQ15436 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23AQ15436 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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