Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
BRD3Q15059 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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BRD3Q15059 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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BRD3Q15059 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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BRD3Q15059 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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BRD3Q15059 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
BRD3Q15059 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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