Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
R3HDM1Q15032 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
R3HDM1Q15032 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
R3HDM1Q15032 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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