Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SHPRHQ149N8 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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SHPRHQ149N8 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
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SHPRHQ149N8 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SHPRHQ149N8 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SHPRHQ149N8 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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