Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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COL19A1Q14993 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
COL19A1Q14993 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
COL19A1Q14993 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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