Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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RAB39AQ14964 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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RAB39AQ14964 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RAB39AQ14964 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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RAB39AQ14964 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RAB39AQ14964 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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