Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DSC3Q14574 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
DSC3Q14574 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms