Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.71□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
SPTAN1Q13813 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SPTAN1Q13813 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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