Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SHROOM2Q13796 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHROOM2Q13796 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHROOM2Q13796 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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