Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RUNX3Q13761 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RUNX3Q13761 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms