Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL4AQ13619 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CUL4AQ13619 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CUL4AQ13619 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CUL4AQ13619 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CUL4AQ13619 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL4AQ13619 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL4AQ13619 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL4AQ13619 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL4AQ13619 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL4AQ13619 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CUL4AQ13619 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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