Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MTMR3Q13615 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MTMR3Q13615 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms