Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX1Q13596 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
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SNX1Q13596 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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SNX1Q13596 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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SNX1Q13596 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SNX1Q13596 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SNX1Q13596 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SNX1Q13596 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX1Q13596 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX1Q13596 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
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