Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LSAMPQ13449 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LSAMPQ13449 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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