Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SP140Q13342 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SP140Q13342 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SP140Q13342 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SP140Q13342 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SP140Q13342 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP140Q13342 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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