Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SKP2Q13309 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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SKP2Q13309 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SKP2Q13309 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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