Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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ERCC8Q13216 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ERCC8Q13216 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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