Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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CBX3Q13185 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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CBX3Q13185 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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CBX3Q13185 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CBX3Q13185 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CBX3Q13185 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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