Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RPA4Q13156 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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