Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1BQ13112 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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