Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHAF1AQ13111 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHAF1AQ13111 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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