Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TRAF1Q13077 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF1Q13077 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms