| FLII | Q13045 | BRDT-206 | ENST00000402388 | 3125 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.440-201 | ENST00000384120 | 114 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1267-201 | ENST00000408723 | 78 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | HMGN2P35-201 | ENST00000412164 | 270 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-181P-201 | ENST00000517234 | 74 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC103810.6-201 | ENST00000606708 | 136 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | CHD9-203 | ENST00000447540 | 11509 nt | TSL 5 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC080100.1-201 | ENST00000624239 | 5356 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | TAB3-205 | ENST00000378933 | 6671 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU1-133P-201 | ENST00000364867 | 167 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP212-201 | ENST00000391223 | 107 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | U8.17-201 | ENST00000391292 | 132 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | SNX2P2-201 | ENST00000424553 | 323 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC092783.1-201 | ENST00000435832 | 231 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-80P-201 | ENST00000459562 | 61 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | AC234781.5-201 | ENST00000508429 | 271 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4287-201 | ENST00000579398 | 78 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | UHMK1-204 | ENST00000545294 | 8117 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| FLII | Q13045 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC016717.2-201 | ENST00000609089 | 5141 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.280-201 | ENST00000364765 | 112 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AL627390.1-201 | ENST00000396055 | 340 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC107297.1-201 | ENST00000459991 | 176 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC103879.1-201 | ENST00000503093 | 255 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-113P-201 | ENST00000516653 | 101 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.712-201 | ENST00000517011 | 92 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SYTL2-230 | ENST00000634661 | 6672 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AP003174.1-201 | ENST00000306533 | 376 nt | TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.273-201 | ENST00000364703 | 102 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA27-201 | ENST00000384323 | 126 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC011753.1-201 | ENST00000451001 | 220 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | IGLV3-17-201 | ENST00000519099 | 244 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1291-201 | ENST00000627649 | 87 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AL596211.1-201 | ENST00000569873 | 2277 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-414P-201 | ENST00000363705 | 104 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP126-201 | ENST00000365092 | 109 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA1.2-201 | ENST00000365189 | 134 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.454-201 | ENST00000384224 | 113 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC026436.1-201 | ENST00000510537 | 270 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP19-201 | ENST00000516016 | 252 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | ATP11C-201 | ENST00000327569 | 6115 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | FAM106DP-201 | ENST00000586416 | 501 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC108081.1-201 | ENST00000604358 | 221 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC008555.8-201 | ENST00000623602 | 2168 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1123P-201 | ENST00000362347 | 106 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-34-201 | ENST00000362441 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-12-201 | ENST00000362583 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-29-201 | ENST00000362834 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-9-201 | ENST00000362912 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-21-201 | ENST00000362963 | 81 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-14-201 | ENST00000363090 | 81 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-13-201 | ENST00000363358 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-41-201 | ENST00000363608 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-11-201 | ENST00000363616 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-5-201 | ENST00000363633 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-39-201 | ENST00000363694 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-4-201 | ENST00000363810 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-16-201 | ENST00000363887 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-6-201 | ENST00000363942 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-42-201 | ENST00000364273 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-15-201 | ENST00000364809 | 81 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-1-201 | ENST00000364961 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-26-201 | ENST00000365067 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-10-201 | ENST00000365073 | 81 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD58C-201 | ENST00000365223 | 64 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-690P-201 | ENST00000365242 | 106 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-43-201 | ENST00000365503 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-36-201 | ENST00000365629 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP192-201 | ENST00000411291 | 327 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SUMO2P16-201 | ENST00000519475 | 264 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | DEFB122-202 | ENST00000569013 | 197 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-40-201 | ENST00000606510 | 82 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC106754.2-201 | ENST00000623006 | 233 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | U6.95-201 | ENST00000636931 | 70 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | MIR302B-201 | ENST00000362188 | 73 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-457P-201 | ENST00000363999 | 107 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.353-201 | ENST00000365440 | 108 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.370-201 | ENST00000365589 | 108 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1056P-201 | ENST00000383996 | 107 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-203P-201 | ENST00000384038 | 104 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | MIR526A1-201 | ENST00000384897 | 85 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1263-201 | ENST00000408324 | 86 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RPS12P2-201 | ENST00000439728 | 269 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SL499P-201 | ENST00000481141 | 276 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RPS26P48-201 | ENST00000491713 | 339 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-240P-201 | ENST00000516098 | 97 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-781P-201 | ENST00000516377 | 101 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | TRAV1-1-201 | ENST00000542354 | 392 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3914-2-201 | ENST00000637339 | 95 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| FLII | Q13045 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.617-201 | ENST00000410920 | 90 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |