Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LMAN2Q12907 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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