Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CPSF1Q10570 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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