Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
HOXC5Q00444 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXC5Q00444 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms