Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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TMOD1P28289 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMOD1P28289 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMOD1P28289 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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